ImageJ閾值設(shè)置
什么是閾值？
閾值可以直觀地理解為門檻，比如在圖像中，我們?cè)O(shè)定門檻，將低于某個(gè)強(qiáng)度（閾值）的像素在視覺上弱化（比如讓它們變成背景），而只突出我們關(guān)心的一些元素。
Threshold…[T]
使用該工具自動(dòng)或交互地對(duì)圖片的閾值下限和上限進(jìn)行設(shè)置，由此可以將圖片劃分為感興趣的部分以及不感興趣的背景。在Analyze?Set Measurements…中的Limitto Threshold選項(xiàng)選中的情況下，使用命令A(yù)nalyze?Measure…[m]可以測(cè)量所選特性的集合。而使用Analyze?Analyze Particles…可以對(duì)單個(gè)特征進(jìn)行測(cè)量。用Wand Tool工具可以描繪出單個(gè)特征的輪廓。
| 選項(xiàng) | 描述 |
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| Upper slider | 調(diào)節(jié)最小閾值。在調(diào)整的同時(shí)按住Shift鍵可以移動(dòng)一個(gè)固定寬度的閾值窗口來框定灰度值范圍。 | | Lower slider | 調(diào)節(jié)最大閾值。 | | Method | 有16中自動(dòng)閾值調(diào)節(jié)方法可供選擇。這些方法描述在Fiji的Auto Threshold
網(wǎng)站上。其中的Default方法是ImageJ1.41及之前版本所采用的IsoData算法。注意這些方法不能應(yīng)用于亮度不均勻的圖片（比如顯微明場(chǎng)像圖片）。在這些（不均勻）的情況下，局部算法更為恰當(dāng)——使閾值在整個(gè)圖片中均勻地變化。這可以通過Auto
Local Threshold插件實(shí)現(xiàn)，該插件預(yù)裝在Fiji中。 | | Display | 在三種顯示模式中選擇一個(gè)。
1.Red 顯示閾值為紅色
2.B&W 將特征顯示為黑色而背景顯示為白色。該模式遵循Process?Binary?Options…中的Black background設(shè)置。
3.Over/Under 將像素值低于閾值下限的像素顯示為藍(lán)色，閾值范圍內(nèi)的像素顯示為灰度級(jí)，而高于閾值的像素顯示為綠色。這些顏色可以通過宏調(diào)用ImageProcessor.setOverColor() 和 SetUnderColor() 方法來修改。 | | Dark background | 當(dāng)特征的亮度比背景亮?xí)r選擇該選項(xiàng)。該狀態(tài)會(huì)一致保留，重啟也不影響。 | | Stack histogram | 如果選項(xiàng)選中，ImageJ會(huì)首先計(jì)算整個(gè)堆棧（或超棧）的直方圖，然后根據(jù)直方圖來計(jì)算閾值。同樣地，所有的切片都利用單個(gè)計(jì)算值進(jìn)行二進(jìn)制化。如果選項(xiàng)未選中，每個(gè)切片的閾值會(huì)單獨(dú)計(jì)算。 | | Auto | 使用當(dāng)前選中的閾值方法在對(duì)直方圖進(jìn)行分析的基礎(chǔ)上來自動(dòng)地對(duì)當(dāng)前圖片或選區(qū)進(jìn)行閾值水平設(shè)置。 | | Apply | 將閾值范圍內(nèi)的像素都設(shè)置為黑色，而剩余的設(shè)置為白色。對(duì)于32-bit浮點(diǎn)數(shù)圖片來說，Apply也將會(huì)運(yùn)行Process?Math?NaN
Background。 | | Reset | 使閾值方法無效并更新直方圖 | | Set | 手動(dòng)輸入新的閾值水平到該對(duì)話框中。 |
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