營改增前，土地使用者將土地使用權(quán)歸還給土地所有者不征收營業(yè)稅，并且《國家稅務(wù)總局關(guān)于單位和個(gè)人土地被國家征用取得土地及地上附著物補(bǔ)償費(fèi)有關(guān)營業(yè)稅的批復(fù)》（國稅函〔2007〕969號）明確規(guī)定：“對國家因公共利益或城市規(guī)劃需要而收回單位和個(gè)人所擁有的土地使用權(quán)，并按照《中華人民共和國土地管理法》規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)支付給單位和個(gè)人的土地及地上附著物（包括不動產(chǎn)）的補(bǔ)償費(fèi)不征收營業(yè)稅。”營改增之后，財(cái)稅〔2016〕36號附件3 《營業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)過渡政策的規(guī)定》規(guī)定：土地所有者出讓土地使用權(quán)和土地使用者將土地使用權(quán)歸還給土地所有者免征增值稅。但對收回土地使用權(quán)給予地上建筑物補(bǔ)償是否繳納增值稅并無明確規(guī)定。湖北國稅營改增政策執(zhí)行口徑第三輯規(guī)定：納稅人將國有土地使用權(quán)交由土地收購儲備中心收儲，取得的建筑物、構(gòu)筑物和機(jī)器設(shè)備的補(bǔ)償收入征收增值稅，取得的其他補(bǔ)償收入免征增值稅。納稅人享受土地使用權(quán)補(bǔ)償收入免征增值稅政策時(shí)，需要出具縣級（含）以上地方人民政府收回土地使用權(quán)的正式文件，包括縣級（含）以上地方人民政府出具的收回土地使用權(quán)文件以及土地管理部門報(bào)經(jīng)縣級以上（含）地方人民政府同意后由該土地管理部門出具的收回土地使用權(quán)文件。因此，根據(jù)湖北省國家稅務(wù)局的口徑，收回土地使用權(quán)取得的補(bǔ)償應(yīng)當(dāng)區(qū)分情況：取得的建筑物、構(gòu)筑物和機(jī)器設(shè)備的補(bǔ)償收入應(yīng)當(dāng)征收增值稅，除此外取得的其他補(bǔ)償收入，包括土地補(bǔ)償以及地面附著物的補(bǔ)償在內(nèi)應(yīng)當(dāng)免征增值稅。

《中華人民共和國土地增值稅暫行條例》（國務(wù)院令〔1993〕第138號）八條第（二）項(xiàng)規(guī)定：因國家建設(shè)需要依法征用、收回的房地產(chǎn)免征土地增值稅?！吨腥A人民共和國土地增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》第十一條第三款規(guī)定：“條例第八條(二)項(xiàng)所稱的因國家建設(shè)需要依法征用、收回的房地產(chǎn)，是指因城市實(shí)施規(guī)劃、國家建設(shè)的需要而被政府批準(zhǔn)征用的房產(chǎn)或收回的土地使用權(quán)。因城市實(shí)施規(guī)劃、國家建設(shè)的需要而搬遷，由納稅人自行轉(zhuǎn)讓原房地產(chǎn)的，比照本規(guī)定免征土地增值稅。符合上述免稅規(guī)定的單位和個(gè)人，須向房地產(chǎn)所在地稅務(wù)機(jī)關(guān)提出免稅申請，經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)審核后，免予征收土地增值稅。而且《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于土地增值稅若干問題的通知》（財(cái)稅〔2006〕21號）第四條規(guī)定，所稱因“城市實(shí)施規(guī)劃”而搬遷，是指因舊城改造或因企業(yè)污染、擾民（指產(chǎn)生過量廢氣、廢水、廢渣和噪音，使城市居民生活受到一定危害），而由政府或政府有關(guān)主管部門根據(jù)已審批通過的城市規(guī)劃確定進(jìn)行搬遷的情況；因“國家建設(shè)的需要”而搬遷，是指因?qū)嵤﹪鴦?wù)院、省級人民政府、國務(wù)院有關(guān)部委批準(zhǔn)的建設(shè)項(xiàng)目而進(jìn)行搬遷的情況。因此，對國家建設(shè)需要而搬遷的，強(qiáng)調(diào)的是國務(wù)院、省級人民政府、國務(wù)院有關(guān)部委批準(zhǔn)的建設(shè)項(xiàng)目，城市實(shí)施規(guī)劃搬遷的原因也進(jìn)行了界定。目前的政策只對因國家建設(shè)需要和城市實(shí)施規(guī)劃搬遷而補(bǔ)償?shù)牟拍苊庹?。但是現(xiàn)實(shí)中被依法收回而搬遷的原因是相當(dāng)復(fù)雜的，如因產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整、國有企業(yè)改制等原因而收回的國有劃撥建設(shè)用地，市、縣人民政府批準(zhǔn)的建設(shè)項(xiàng)目而依法收回的等，這些能否免征土地增值稅沒有明確。

根據(jù)《中華人民共和國企業(yè)所得稅法》（中華人民共和國主席令第六十三號）規(guī)定：企業(yè)每一納稅年度的收入總額，減除不征稅收入、免稅收入、各項(xiàng)扣除以及允許彌補(bǔ)以前年度虧損后的余額，為應(yīng)納稅所得額。另外，根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于發(fā)布<企業(yè)政策性搬遷所得稅管理辦法>的公告》（國家稅務(wù)總局公告2012年第40號）規(guī)定，符合政策性搬遷的企業(yè)，企業(yè)的搬遷收入，扣除搬遷支出后的余額，為企業(yè)的搬遷所得。企業(yè)應(yīng)在搬遷完成年度，將搬遷所得計(jì)入當(dāng)年度企業(yè)應(yīng)納稅所得額計(jì)算納稅。企業(yè)政策性搬遷，是指由于社會公共利益的需要，在政府主導(dǎo)下企業(yè)進(jìn)行整體搬遷或部分搬遷。企業(yè)由于下列需要之一，提供相關(guān)文件證明資料的，屬于政策性搬遷：（一）國防和外交的需要；（二）由政府組織實(shí)施的能源、交通、水利等基礎(chǔ)設(shè)施的需要；（三）由政府組織實(shí)施的科技、教育、文化、衛(wèi)生、體育、環(huán)境和資源保護(hù)、防災(zāi)減災(zāi)、文物保護(hù)、社會福利、市政公用等公共事業(yè)的需要；（四）由政府組織實(shí)施的保障性安居工程建設(shè)的需要；（五）由政府依照《中華人民共和國城鄉(xiāng)規(guī)劃法》有關(guān)規(guī)定組織實(shí)施的對危房集中、基礎(chǔ)設(shè)施落后等地段進(jìn)行舊城區(qū)改建的需要；（六）法律、行政法規(guī)規(guī)定的其他公共利益的需要。因此，政府收回土地使用權(quán)首先看是否屬于政策性搬遷，如果符合政策性搬遷，在搬遷完成年度（最長5年）將搬遷所得計(jì)入當(dāng)年度企業(yè)應(yīng)納稅所得額計(jì)算納稅；如果不符合政策性搬遷，應(yīng)在取得搬遷收入當(dāng)年將收入并入全部收入計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

根據(jù)《中華人民共和國契稅暫行條例細(xì)則》第十五條的規(guī)定，土地、房屋被縣級以上人民政府征用、占用后，重新承受土地、房屋權(quán)屬的，是否減征或者免征契稅，由省、自治區(qū)、直轄市人民政府確定。另外，根據(jù)《中華人民共和國契稅暫行條例》第一條規(guī)定，在中華人民共和國境內(nèi)轉(zhuǎn)移土地、房屋權(quán)屬，承受的單位和個(gè)人為契稅的納稅人，應(yīng)當(dāng)依照本條例的規(guī)定繳納契稅。第二條規(guī)定，本條例所稱轉(zhuǎn)移土地、房屋權(quán)屬是指下列行為：（一）國有土地使用權(quán)出讓；（二）土地使用權(quán)轉(zhuǎn)讓，包括出售、贈與和交換；（三）房屋買賣；（四）房屋贈與；（五）房屋交換。政府收回土地使用權(quán)不屬于土地使用權(quán)轉(zhuǎn)讓，所以，政府收回土地使用權(quán)不屬于契稅征稅范圍。

根據(jù)《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于印花稅若干政策的通知》（財(cái)稅〔2006〕162 號）第三條規(guī)定，對土地使用權(quán)出讓合同、土地使用權(quán)轉(zhuǎn)讓合同按產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)移書據(jù)征收印花稅。 因此，土地部門收回土地所簽訂的合同不屬于應(yīng)稅合同，不用繳納印花稅。